美朱高中毕业后与魏婚后怀孕，本应享受美好生活，但暗恋魏之女学生意外得到四神天地书，开启后进入书中，并想取代美朱成为朱雀巫女，目的是改写历史，夺去美朱的一切包括她的身份。可是这样会令美朱的胎儿及性命随时不保，知道事情的魏为了拯救美朱将再次进入四神天地书。可是当他到达里面却发现世界被一层阴霾所覆盖，

　　在古老的传说中，长有洁白羽翼的公主被禁锢在房间之中，希冀这外面的世界。某日，一位神秘的少年出现在了公主的面前，成为了公主唯一的朋友。透过少年之口，公主得以知道大千世界里发生的种种。然而，当公主和少年相爱之时，曾经的诅咒应验了。　　神尾观铃（川上伦子 配音）自小体弱多病，孱弱的身体令她无法去学校上

　　“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。　　身为帝国王子的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜丽幸福的世界，而使用GEASS，令人